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WinterIsComing(31822)
发表于2020年11月23日 13时45分 星期一
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报道称,中国使用英特尔 CPU 和英伟达 GPU 建造用于监控的超算。英特尔和英伟达均表示,对于其所谓自身技术遭到滥用的情况,并不知情。超算由中科曙光供应,曙光是中国最大的超算供应商之一。英伟达发言人表示,自去年特朗普政府颁布禁令以来,中科曙光就“不再是英伟达的重要客户”了。他还指出,英伟达自那以后没有再向中科曙光提出技术支持。英特尔仍在向中科曙光销售低端芯片,公司发言人表示,如果发现客户使用它们的产品侵犯人权,就会限制或停止与其的业务往来。
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WinterIsComing(31822)
发表于2020年11月17日 17时51分 星期二
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Top 500 公布了最新的榜单,日本 ARM 超算富岳再次登顶。富岳安装在神户的日本理化所计算机科学中心,其处理器为富士通公司的 48/52 核 A64FX ARM v8.2-A,采用了可缩放矢量扩展(Scalable Vector Extension)和 512 位实现,为高性能计算进行了优化,由台积电 7 纳米工艺制造,晶体管数量 878.6 亿。A64FX 包含 48 个计算核心和 2 到 4 个辅助核心,没有 GPU 加速器,封装了 HBM2 内存。富岳的处理器核心数从今年上半年的 7,299,072 增加到了 7,630,848,运算性能达到 442 petaflops,是第二名美国橡树岭国家实验室 IBM 超算 Summit 的 3 倍。排名前十的超算出现了两个新人:富岳,Summit (148.6 petaflops),Sierra,神威太湖之光,英伟达超算 Selen(使用 AMD EPYC 处理器和英伟达 A100 GPU,性能 63.4 petaflops),天河二号 A,新上榜德国超算 JUWELS Booster Module(44.1 petaflops),HPC5(意大利),Frontera,新上榜沙特超算 Dammam-7(22.4 petaflops)。中国依旧保持超算数量第一有 212 台,美国 113 台,日本 34 台,美国超算的总性能高于中国,以 668.7 petaflops 超过中国的 564.0 petaflops。500 台超算中使用英特尔 CPU的超过九成,AMD CPU 的有 21 台,Power 处理器 10 台,ARM 5 台。
医学
WinterIsComing(31822)
发表于2020年09月03日 15时10分 星期四
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美国科学家在夏天使用橡树岭国家实验室的 Summit 超算分析了来自 1.7 万个基因样本的 4 万多个基因数据,此举旨在加深对 Covid-19 的理解。Summit 是世界第二快的超算,它花了一周多时间处理了这些数据。研究人员对结果进行了分析,揭示了 Covid-19 如何影响人体的新理论——缓激肽假说(bradykinin hypothesis)。假说提供了一个模型解释 Covid-19 的很多方面,包括最奇特的症状。它还提出了十多种潜在疗法,其中部分已经被 FDA 批准。研究发现发表在《eLife》期刊上。根据这一研究发现,Covid-19 的感染通常是从鼻部的 ACE2 受体进入人体的,然后在人体内进入其它存在大量 ACE2 受体的组织如肠道、肾脏和心脏。这能部分解释新冠的心脏和胃肠道症状。一旦 Covid-19 在人体内取得立足之地,事情开始变得有意思了。Summit 分析的数据显示,Covid-19 不再满足于简单感染已表达大量 ACE2 受体的细胞,它开始主动劫持人体自身系统,欺骗它去上调 ACE2 受体表达较低水平或中等水平的组织,如肺部。肾素血管紧张素系统(RAS)控制着循环系统的众多方面,包括名叫缓激肽的化合物水平。缓激肽有助于调节血压。当 Covid-19 微调 RAS 系统时,会导致调节缓激肽的机制出现混乱。缓激肽受体再次致敏,而人体也停止有效分解缓激肽。研究人员称,最终结果是释放缓激肽风暴——缓激肽在人体内失控积累。根据缓激肽假说,正是它导致了许多致命结果。FDA 已经批准了多种针对 RAS 系统的药物,它们能减少缓激肽的产生,阻止致命的缓激肽风暴。研究人员还指出,维生素 D 可能是一种潜在的治疗药物,有助于阻止缓激肽风暴的形成。
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ai(3896)
发表于2020年07月06日 14时19分 星期一
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日本京都大学的科学家利用理化所全球最快超算“富岳”,找到了数十种可作为新冠传染病候选治疗药物的物质。这些物质有望阻碍病毒在细胞内增殖。科学家计划今后使用细胞进行实验,以确认其效果。模拟实验锁定了有望对治疗新冠产生效果的数十种药物。其中包括 12 种全球正在为治疗新冠展开临床试验的药物。这些药物包括驱虫药“氯硝柳胺”(Niclosamide)和“硝唑尼特 ”(Nitazoxanide)等,硝唑尼特正在美国和墨西哥进行临床试验。富岳原计划 2021 年投入使用,但为了研究新冠而于今年 4 月提前开始试用。
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WinterIsComing(31822)
发表于2020年06月23日 09时56分 星期二
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Top 500 公布了最新的榜单,日本基于 ARM 架构的超算富岳登顶,其 Linpack 运算性能达到 415.5 petaflops,是排在第二位的美国橡树岭国家实验室 IBM 超算 Summit 的 2.8 倍。富岳(PDF)安装在神户的日本理化所计算机科学中心,其处理器为富士通公司的 48/52 核 A64FX ARM v8.2-A,采用了可缩放矢量扩展(Scalable Vector Extension)和 512 位实现,为高性能计算进行了优化,由台积电 7 纳米工艺制造,晶体管数量 878.6 亿。A64FX 包含 48 个计算核心和 2 到 4 个辅助核心,没有 GPU 加速器,封装了 HBM2 内存。富岳总共有 158,97 个节点,峰值功率 28.33MW,使用水冷冷却系统,运行的操作系统为 Red Hat Enterprise Linux 8 和 McKernel(轻量级多内核操作系统)。Top 10 超算还有 Summit (148.6 petaflops),Sierra,神威太湖之光,天河二号 A,HPC5(意大利),Selene,Frontera,Marconi-100 和 Piz Daint。中国依旧保持超算数量第一有 226 台,美国 114 台,日本 30 台,法国 18 台,德国 16 ,美国超算的总性能高于中国。联想制造的超算数量再次保持第一,共有 180 台,之后是曙光 (68),浪潮 (64),HPE (37),克雷/HPE (35),富士通 13。500 台超算中 469 台使用英特尔 CPU,AMD CPU 的有 11 台。
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WinterIsComing(31822)
发表于2020年04月16日 12时36分 星期四
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蛋白质折叠分布式计算项目 Folding@home 最近发起了 COVID-19 项目,以帮助科学家更好的理解新冠病毒,了解其与 ACE2 受体是如何相互作用的,帮助开发治疗方法。这一行动受到了许多人的响应,短时间内用户数增长了 12 倍,从 3 万增加到了 40 万。上月底,Folding@home 项目的算力突破了 exaFLOP 大关,领先英特尔、AMD 和克雷等公司一到两年。相比另一个最近终止的著名分布式计算项目 SETI@Home,Folding@home 可谓硕果累累,产生了 233 篇论文,其主要研究包括了激酶的动态性,G蛋白偶联受体,耐药菌和埃博拉病毒蛋白质。Folding@home 的峰值性能达到了 1.5 exaFLOPs,是世界最快超算 Summit 的 7 倍多。
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wenfeixiang(25847)
发表于2019年11月19日 11时57分 星期二
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Top 500 周一公布了最新一期的榜单,前 10 的超算没有变化,但入榜门槛从上半年的 1.022 petaflops 提高到 1.14 petaflops。排在前十的超算为:橡树岭国家实验室的 IBM 超算 Summit 运算速度 148.6 petaflops;劳伦斯利物莫国家实验室的 IBM 超算 Sierra 运算速度 94.6 petaflops,中国的神威太湖之光第三运算速度 93 petaflops;天河二号 A 以 61.4 petaflops 排名第四;得州大学的超算 Frontera 以 23.5 petaflops 排名第五;之后是瑞士的 Piz Daint(21.2 petaflops),美国的 Trinity(20.2 petaflops),日本富士通公司制造的 AI Bridging Cloud Infrastructure (ABCI,19.9 petaflops),德国的联想超算 SuperMUC-NG(19.5 petaflops),劳伦斯的 Lassen(18.2 petaflops)。在 Top 500,中国有 227 台,数量继续保持第一,美国 118 台,日本 29 台,法国 18 台,德国 16 ,荷兰 15,爱尔兰 14,英国 11 。联想制造的超算数量再次保持第一,共有 174 台,之后是浪潮 (71),曙光 (65),克雷 (36)和HPE (35),克雷已被 HPE 收购,两家的超算总数和浪潮相同。500 台超算中 470 台使用英特尔 CPU,IBM 有 14 台,AMD 有 3 台。
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wenfeixiang(25847)
发表于2019年10月17日 18时01分 星期四
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Top 500 榜单中的大部分超算使用的都是英特尔的处理器,但随着 AMD 的 CPU 再次表现出强大的竞争力,越来越多的超算也开始使用 AMD 的服务器处理器 Epyc。HPE 旗下的 Cray 公司与英国政府签署了 7900 万英镑的交易去建造 28-petaFLOPS Archer2 超算,这是英国至今最强大的超算。Archer2 将取代它的前任 Archer 超算,后者运算速度 2.6-petaFLOPS,使用英特尔的 Xeon E5 v2 处理器。和 Archer 一样,Archer2 将安装在爱丁堡大学,它将包含 5,848 个计算节点,每个节点由两个 64 核 AMD Epyc Rome 组成,处理器频率 2.2GHz,共 748,544 个 CPU 核心,系统内存 1.57PB。系统设计主要使用 AMD 的 CPU,但有四个计算节点连接了 16 个 AMD GPU。
五七桐
wenfeixiang(25847)
发表于2019年08月19日 15时08分 星期一
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日本宣布理化学研究所的超算“京”退役,将于 8 月 30 日关闭电源后拆除。“京”目前排名 Top500 名单第 20 名,采用 SPARC64 VIIIfx 处理器,峰值计算能力 11.28 petaflops。“京”由富士通公司制造,该公司计划中接替 “京”的下一代超算将采用 64 位 ARM 处理器,速度将达到 400 petaflops,是目前最快的超算美国的 Summit 的两倍,新超算取名为富岳,计划在 2021 年投入使用。
长城
WinterIsComing(31822)
发表于2019年06月24日 15时54分 星期一
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在华为之后,美国政府又将五个中国实体列入出口管制黑名单,禁止它们在没有得到美国政府豁免的情况下购买美国的技术和零部件。这些企业和研究机构包括:中科曙光;曙光设计芯片的子公司天津海光、成都海光集成电路和成都海光微电子技术;以及无锡江南计算技术研究所。美国商务部称,这些实体是中国高性能计算机发展的领导者,它们的一些产品用于军事领域,比如核爆炸的模拟。其中天津海光与 AMD 成立了合资企业开发基于 Zen 机构的服务器处理器。美国将中国最主要的超算制造商和研究机构都列入了黑名单(曙光、江南所和国防科技大学),根据最新的 Top 500 名单,中国的超算数量高居世界第一,绝大部分超算使用了英特尔处理器。
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wenfeixiang(25847)
发表于2019年06月17日 18时00分 星期一
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Top 500 周一公布了最新一期的榜单,榜单上的最后一名是一台联想超算,运算速度 1.022 petaflops,这意味着 Top 500 现在是 Petaflop 俱乐部了。排在前十的超算基本没变:橡树岭国家实验室的 IBM 超算 Summit 运算速度从去年底的 143.5 petaflops 提升到了 148.6 petaflops;劳伦斯利物莫国家实验室的 IBM 超算 Sierra 运算速度没变仍然是 94.6 petaflops,中国的神威太湖之光第三运算速度 93 petaflops;天河二号 A 以 61.4 petaflops 排名第四;得州大学的超算 Frontera 以 23.5 petaflops 排名第五;之后是瑞士的 Piz Daint(21.2 petaflops),美国的 Trinity(20.2 petaflops),日本富士通公司制造的 AI Bridging Cloud Infrastructure (ABCI,19.9 petaflops),德国的联想超算 SuperMUC-NG(19.5 petaflops),劳伦斯的 Lassen 在升级后运算性能从 15.4 petaflops 提升到了 18.2 petaflops。在 Top 500,中国有 219 台,数量继续保持第一,美国 116 台,日本 29 台,法国 19 台,英国 18 台,德国 14 台。联想制造的超算数量再次保持第一,共有 173 台,之后是浪潮 (71),曙光 (63),HPE (40),克雷 (39),Bull (21),富士通 (13),IBM (12)。虽然 IBM 只有 12 台,但前十有多台都是 IBM 制造的,总运算速度达到 207 petaflops,仅次于联想。英特尔份额占 95.6%,IBM 有 7 台,AMD 有 3 台。
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wenfeixiang(25847)
发表于2019年05月17日 18时30分 星期五
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彭博援引知情人士的消息报道,HP Enterprise 接近完成收购 Cray 的交易谈判,结果最早将在本周宣布,最终协议还没有达成,因此也可能会推迟。Cray 是著名超级计算机制造商,其市值在 12 亿美元左右。收购 Cray 将加强 HP Enterprise 在高端计算机系统的地位。Cray 公司源自 1972 年超算之父 Seymour Cray 的 Cray Research,Cray Research 被 SGI 收购后 Cray 公司通过收购原 Cray Research 资产而于 2000 年成立,而 SGI 所有股份则被 HP Enterprise 在 2016 年收购。
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wenfeixiang(25847)
发表于2019年05月08日 15时28分 星期三
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AMD 宣布与克雷公司合作制造 1.5 Exaflops 超算 Frontier。两家公司预测 Frontier 到 2021 年交付给美国能源部橡树岭国家实验室时会是世界上最快的超算,美国能源部另一台在 2021 年交付的超算 Aurora 使用英特尔处理器,运算速度为 1 Exaflops。Frontier 的 CPU 是 AMD 的下一代定制 Epyc 处理器,基于专为高性能计算和 AI 工作负荷优化的新 Zen 核心(可能是 Zen 3 或 Zen4),GPU 则是 Radeon Instinct。GPU 和 CPU 的比例是 4 比 1,也就是 1 个 Epyc CPU 连接 4 个 Radeon Instinct GPU。
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wenfeixiang(25847)
发表于2019年03月19日 16时52分 星期二
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南华早报援引知情人士的消息报道,中国计划投资数十亿美元升级它的超级计算机,重新夺回最快超算的称号。在 Top500 排行榜,中国的超算自 2013 年起一直排在第一位,但去年美国的超算 Summit 夺回了第一的位置,结束了中国长达五年的统治。报道称,中国的目标是其最新的曙光超算性能将超过 Summit 的 50%——即超过 200 petaflops。来自中央政府和地方政府的资金将用于升级现有的超算设施,青岛海洋科技国家实验室、天津国家超算中心和深圳国家预计分别到 2020、2021 和 2022 年升级到 exascale——即 1000 petaflops。美国则计划到 2021 年交付第一台 exascale 超算。
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wenfeixiang(25847)
发表于2019年03月19日 15时36分 星期二
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美国能源部披露了预计在 2021 年交付给阿贡国家实验室的超算的 Aurora 细节,它预计将是美国第一台运算性能突破 exascale 级的超算。中国此前宣布计划在 2020 年交付三台 exascale 级超算。Aurora 的投资高达 5 亿美元,将由英特尔与 Cray 和阿贡国家实验室联手打造,使用英特尔尚未发布的加速处理器,Xeon 处理器,新的内存和通信技术。
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pigsrollaroundinthem(39396)
发表于2018年11月24日 21时32分 星期六
来自小米超算
中国高性能计算重点研发专项总体组组长钱德沛在 SC18 会议上透露了正在部署的三个 Exascale 级超算系统的细节。三个新超算分别为曙光、天河和神威,计划中的峰值性能 1 exaflop,最小内存容量 10 PB,节点到节点带宽 500Gbps,每节点功耗 30 gigaflops/watt。其中曙光的原型采用了 AMD 授权的 Hygon x86 CPU 和加速器,每个节点包含 2 个 Hygon x86 CPU 和 2 个 Hygon DCU(加速器),原型包含 512 个节点,目前的配置只使用了一半的 DCU ,峰值性能 3.18 petaflops。天河原型安装在天津超算中心,目前所知不多,它依旧笼罩在神秘之中,其处理器可能是基于 ARM 架构,包含 512 个节点,峰值性能 3.14 petaflops。神威原型使用 260 核的申威 26010 处理器,该处理器目前被用于神威太湖之光,每个节点使用 2 个处理器,512 个节点的性能 3.13 petaflops,每节点功耗仅为 11 gigaflops/watt。
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pigsrollaroundinthem(39396)
发表于2018年11月13日 11时48分 星期二
来自Power 最强
根据本周公布的最新一期 Top 500 榜单,美国占了 Top 10 中的五个,巩固了其领先优势,中国超算的性能虽然落后于美国,但数量上占优,扩大了在 Top 500 榜单的份额。在 Top 10 中,美国能源部橡树岭国家实验室的 IBM 超算 Summit 继续登顶,运算速度从上半年的 122.3 petaflops 提升到 143.5 petaflops,第二是劳伦斯利物莫国家实验室的 IBM 超算 Sierra,运算速度也从上半年的 71.6 提升到了 94.6 petaflops,正好超过中国的神威太湖之光,IBM 的超算使用了 Power9 CPU 和 NVIDIA Tesla V100 GPU;神威太湖之光从上半年的第二降至第三,性能和以前一样,93 petaflops;天河二号A 以 61.4 petaflops 排名第四,之后是瑞士的 Piz Daint(21.2 petaflops),美国的 Trinity(20.2 petaflops),日本富士通公司制造的 AI Bridging Cloud Infrastructure (ABCI,19.9 petaflops),德国的联想超算 SuperMUC-NG(19.5 petaflops),美国橡树岭的泰坦(17.6 petaflops)和劳伦斯的 Sequoia(17.2 petaflops)。在 Top 500,中国有 227 台,美国 109 台,日本 31 台,英国 22 台,法国 18 台,德国 17 台。联想制造的超算数量再次保持第一,共有 140 台,之后是浪潮(84),曙光 (57),克雷 (49),HPE (46),Bull (22),富士通 (15), 华为(14),Dell EMC (13)和 IBM (12)。英特尔份额占 95.2%,AMD 有 3 台,还有一台超算使用 ARM 处理器,超算 Astra 由 HPE 制造,使用了 125,328 个 Cavium ThunderX2 核心,速度 1.5 petaflops,排在 205 位。曙光的 Advanced Computing System (PreE)使用了 Dhyana CPU,该 CPU 是成都海光从 AMD 授权的 EPYC 处理器。所有超算都运行 Linux 操作系统。
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pigsrollaroundinthem(39396)
发表于2018年08月28日 12时01分 星期二
来自竞争第一
富士通公布了下一代超算的 CPU 细节。被临时命名为 Post-K 的超算运算速度预计将是 K(京)的 100 倍,将突破 exascale,预计于 2021 年投入使用。K(京)超算使用的是原 Sun 的 SPARC64 处理器,而 Post-K 切换到 ARM 架构的 A64FX,使用 7 纳米工艺制造,包含 87.86 亿个晶体管,它将是第一款实现为高性能计算设计的 Scalable Vector Extension(SVX) 指令的 ARM 处理器。富士通已经生产出处理器原型,开始了初步测试。A64FX 由 64 个计算核心和 4 个辅助核心构成,512 位宽矢量运算,FP64 浮点性能超过 2.7 teraflops,FP32 浮点性能超过 5.4 teraflops,FP16 浮点运算性能超过 10.8 teraflops。
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pigsrollaroundinthem(39396)
发表于2018年06月26日 21时12分 星期二
来自开源软件
根据最新一期的 TOP 500 榜单,美国的超算再次越跃居世界第一,但中国建造了更多的超算。在 TOP 500 榜单中排名前五的制造商中,中国公司占三家。联想第一、浪潮第三、曙光第五。中国顶级的超级计算机研究人员钱德沛对中国过去十年取得的进展惊叹不已。“超出了我们的预期,” 他说。特别值得骄傲的一点是,神威·太湖之光使用的是国产微处理器。“过去这是一个弱势,” 同时在中山大学和北京航空航天大学任教的计算机科学教授钱德沛说。尽管中国取得了惊人的进步,但钱德沛说,在某些先进的硬件技术,尤其是软件方面,中国依然落后。“软件对我们来说是个棘手的问题,” 他说。“需要的时间更长。”但超级计算机专家表示,中国在软件研发方面也在迎头赶上。“如今中国的重点中心与我们的惊人地相似,”伊利诺伊州阿贡国家实验室副主任 Rick Stevens 说。
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pigsrollaroundinthem(39396)
发表于2018年06月25日 20时16分 星期一
来自没人用 Windows
根据本周一公布的最新一期 Top 500 榜单,美国能源部橡树岭国家实验室的 IBM 超算 Summit 超过中国神威太湖之光成为世界最快的超算,这是美国自 2012 年以来首次在超算的运算速度上跃居第 1 位。Summit 运算速度 122.3 petaflops,由 4,608 个节点构成,每个节点包含 2 个 22 核的 Power9 CPU 和 6 个 NVIDIA Tesla V100 GPU,共 9216 个 CPU 和 27648 个 GPU;神威太湖之光以 93 petaflops 排名第二;劳伦斯利物莫国家实验室的 IBM 超算 Sierra 第三,运算性能 71.6 petaflops,其结构类似 Summit,但节点和 GPU 更少,它有 4,320 个节点,每个节点包含 2 个 Power9 CPU 和 4 个 NVIDIA Tesla V100 GPU;天河二号A 以 61.4 petaflops 排名第四,它最近用定制协处理器 Matrix-2000 替换了英特尔的 Xeon Phi;第五是日本富士通公司制造的 AI Bridging Cloud Infrastructure (ABCI),运算速度 19.9 petaflops。前 10 还有瑞士的 Piz Daint,美国橡树岭的泰坦、劳伦斯的 Sequoia,Trinity 和 Cori,其中 Cori 的性能仍然有 14.01 petaflops。在 Top 500,联想制造的超算数量首次跃居第一,共有 122 台,其次是 HPE 的 79 台,浪潮的 68 台,克雷 56 台,曙光的 55 台。IBM 虽然只有 19 台,但前三有两台都是 IBM 超算,其总运算性能占到了 Top 500 总性能的 19.9%,其次是克雷的 16.5%,联想的 12.0 %。Top 500 中,中国有 206 台,美国 124 台,日本 36 台,德国 21 台,法国 18 台,英国 22 台。虽然中国的超算数量最多,但美国超算的性能仍然以 37.8% 高居第一,中国第二 29.3%。所有超算都运行 Linux 操作系统。
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