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发表于2016年11月10日 15时51分 星期四
来自那东西有毒
现代人类祖先走出非洲后,在欧亚大陆上遭遇了尼安德特人和丹尼索瓦人,与这些近亲进行了亲密的跨种交配。这意味着他们的第一代后裔携带了一半的尼安德特人和一半的现代人类基因。但今天现代欧洲人携带的尼安德特人基因从50%减少到了2%。这里面究竟发生了什么?尼安德特人基因在一代代的遗传中是被稀释掉了还是被选择性淘汰掉了?加州戴维斯的研究人员构建了数学模型,观察尼安德特人基因在不同情况下的演变。他们构建的与现实最匹配的模型认为尼安德特人基因是被选择性淘汰掉了。尼安德特人基因的多样性很小,暗示他们的人口规模并不大,这意味着他们的基因并不足够优秀到能在优胜劣汰中生存下来。在现代人类中间传播的尼安德特人基因最终绝大部分都被淘汰掉了。
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发表于2016年10月26日 21时00分 星期三
来自为了活着
生物学中一个令人好奇的事实是:酵母的6000个基因中只有五分之一是必要的,如果毁掉大约1200个关键基因的任何一个,结果将会是死亡;而剔除掉其它非必要基因中的一个,它不会有任何事。但是,如果剔除掉非必要基因中的一对,有时候死亡将会很快来临。失去一个不致命,但失去两个却是灾难性的。这些关联基因通常有着相似的功能,比如修复受损的DNA。多伦多大学的生物学家 Charles BooneBrenda Andrews想找到一个问题的答案:我们是否可以通过剔除成对的基因来发现它们的功能?他们从17年前开始寻找答案,培育了2300万酵母菌株,每个都失去了一对基因,观察酵母是活着,还是死去,或者是生病,从而获取到有关基因之间存在关联性的数据。他们的研究报告发表在上个月的《科学》期刊上。他们发现了55万对有关联的基因,移除它们会导致死亡或生病。基因关联性的网络揭示了生命的隐藏链接
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发表于2016年10月20日 20时43分 星期四
来自花心的人类
生殖器疣或HPV的历史比我们想象的更遥远。根据发表在《Molecular Biology and Evolution》期刊上的一项研究,对HPV演化史的跟踪发现,一种广泛流行的HPV变种来源于尼安德特人和丹尼索瓦人。尼安德特人和丹尼索瓦人在50万年前离开非洲时携带了自己的HPV变种,留在非洲的现代人类祖先有自己的独特变种。随着两种人类的演化,病毒也跟着演化,直到他们在数万年前相遇为止。不同种族之间的未保护性交将尼安德特人和丹尼索瓦人的HPV16A传给了现代人类。
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发表于2016年10月15日 22时05分 星期六
来自等着反转
匿名读者 写道 "河北科技大学公开回应道已有机构运用了韩春雨的技术,合作正在洽谈中。韩春雨论文共同作者沈啸则首次回应,声称不会逃避责任,韩春雨仍在持续研究和改良技术。他并未参与实验过程,但信任韩,认为韩可能需要合作机构同意才能公布数据,他在自己的实验室不严格重复了实验,发现了论文没提及的有趣现象。不知道韩还有什么关键技术没有公开,不知道为什么其他人重复不出来。声称不要误解政府给予的两亿经费,对非知名高校能获得国家重大基金支持印象深刻。实验的资金基本来自韩春雨自筹,并未投入自己的资金。认为只有《自然-生物技术》这样的机构进行调查,韩春雨才需要自证清白。《自然》仍未就调查与他联系。基因编辑技术专利遗漏了河北科技大学,将变更为共申请人。"
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发表于2016年10月13日 13时10分 星期四
来自学习先进程序
名叫WO的病毒被发现盗窃了毒蜘蛛黑寡妇制造毒素的基因编码。研究报告发表在《Nature Communications》期刊上。研究人员发现,WO携带的一些基因跟昆虫和蜘蛛携带的基因十分相近。研究人员猜测,WO 很可能需要借助这些基因的力量才能渗透到动物细胞里,进而袭击它要感染的细菌。WO属于噬菌体病毒,专门感染沃尔巴克氏体细菌;被WO感染的沃尔巴克氏体菌再去感染昆虫和蜘蛛的细胞。病毒“抄袭”了黑寡妇生成蛛毒素的基因编码。研究报告作者推测,偷基因编码的动机可能是拥有这种基因编码,WO就可以在细胞膜上打洞。这是WO病毒出入真核细胞的可能途径之一。WO抄袭的不仅是黑寡妇的基因编码,它的染色体内还发现若干其他基因。
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发表于2016年10月11日 20时17分 星期二
来自下一次在人身上试验
日本信州大学的科学家在《自然》期刊上发表研究论文,报告狝猴干细胞发展成的心肌细胞可用于再生另一只狝猴受损的心脏。移植的捐赠者干细胞没有发现引发接受者免疫系统的排斥反应。但接受者的心脏在移植后的前四周遭遇了不规则心脏搏动,但这不具有致命性。使用捐赠者而不是患者自己的细胞去诱导多功能干细胞发展出心肌细胞被认为简化了制造,但增加免疫排斥风险。信州大学的Yuji Shiba和同事通过匹配表面蛋白质克服了这一难题。
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发表于2016年10月10日 17时13分 星期一
来自还吃得香
匿名读者 写道 "因实验难以重现而备受争议的河北科技大学副教授韩春雨接受了《科技日报》的采访。对于批评,韩春雨称,有人在网上说,韩春雨现在怎么睡得着?“我告诉你,我睡得很好”。记者建议他在摄像头下重复实验,韩春雨称,“这是有罪推论,我觉得没必要。日本的小保方晴子是没有一家实验室重复出来,而我这个实验已经有人重复出来,连《自然》的记者David都调查过了,我为什么要自证清白,自己有病吗?”记者提醒他《自然》发表过声明,记者的报道不能代表杂志的调查结果。"
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发表于2016年10月09日 20时05分 星期日
来自所以不要节性
根据发表在《神经科学杂志》期刊上的一项研究,和还无性交经验的大鼠相比,每天都曾性交的大鼠在节制性欲期间更倾向于渴望安非他命安非他明是一种具有成瘾性的管制药品。性交和安非他命刺激的大脑区域是相同的,即所谓的腹侧被盖区。这个区域负责生成神经递质多巴胺,是大脑天然的奖励系统的一个组成部分。性交也是一种天然奖励,它让我们感觉舒适快活,让我们期望经常重复这一活动。毒品针对的,同样也是人大脑的奖励系统,因此才会使人如此快地上瘾。研究人员在论文中写道,“性交经验之后,再节制一段时间的性欲,会提高雄性大鼠体内对安非他命的奖励值。”与其还无性交经验的同类相比,已有性交经验的大鼠更快、而且在更小剂量下就会对安非他命产生依赖。科学家们称其为“更易伤性”,也就是说毒品对这些动物的作用更大。实验表明,连续五天性交,之后节制七天,就足以激发其大脑发生变化。
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发表于2016年09月28日 10时57分 星期三
来自两个母亲一个父亲
《新科学家》宣布,采用一种新的“3人共同生育”技术的首名婴儿诞生。这名男婴现在已经5个月大,他有他父母的主要遗传基因DNA,也采用了一名捐献者的遗传基因。医学专家说,此举预示着医学新时代的开启,这项技术有助于帮助那些携带有罕见遗传性疾病的家庭生育健康的婴儿。但他们警告说,这种名为线粒体捐赠的新的、有争议的技术尚未完备,仍然需要更充足的核实证明。有些妇女线粒体有遗传缺陷,并会遗传给婴儿。线粒体的一个重要特点是只能由母亲的卵子遗传,父亲的精子不会产生线粒体遗传作用。该技术将母亲提供的卵子中有缺陷的DNA剔除,替换上另一名健康女性捐献的卵子DNA,然后和父亲提供的精子合成胚胎。新生的健康婴儿的0.1%的基因来自捐献者,其它所有基因都是父母的。
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发表于2016年09月26日 19时59分 星期一
来自改名拜耳孟山都
孟山都与MIT和哈佛的Broad学院达成协议,授权在转基因作物上运用CRISPR-Cas基因编辑技术。孟山都计划在玉米和大豆等作物上运用CRISPR-Cas技术编辑基因,使这些作物的产量更高,更能抵抗疾病和干旱。CRISPR-Cas允许研究人员更具有针对性的替换和移除DNA片段,比传统的作物育种更高效。Broad学院与学术界和非营利组织分享其研发技术和工具,与孟山都的非独占协议是该机构首次授权在农业中运用其技术。为了减少伦理和安全方面的担忧,比如被用于基因驱动和培育出不育的种子迫使农民年年购买,Broad学院在这两方面施加了限制。
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发表于2016年09月22日 17时30分 星期四
来自二手烟也会
研究人员发现,吸烟会对DNA留下明显的痕迹,大部分痕迹会随时间而褪去,但还有部分会永久性留下来。对1.6万人的DNA分析发现,如果戒烟的话大部分吸烟留下的致病遗传痕迹会在5年内消失。吸烟过程留下的遗传标记是甲基化,这种对DNA的修改会导致一个基因失去活性或改变其功能,这种改变经常会引发疾病。研究人员说,强有力的证据显示吸烟会对人体的分子机制产生持久的影响,这种影响能持续30年以上。
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发表于2016年09月19日 16时52分 星期一
来自演化
根据发表在《Science Advances》期刊上的一项研究,转基因作物的广泛采用减少了杀虫剂的使用,但由于杂草增强了抵抗力而增加了除草剂的使用。从2008年起,美国种植的玉米和大豆超过八成都是转基因品种。转基因玉米修改了两个基因:其一能杀死吃种子的昆虫,其二能抵抗常用除草剂草甘膦。而转基因大豆只修改了抵抗草甘膦的基因。结果没有让人感到意外:种植转基因玉米的农民大幅减少了杀虫剂的使用;种植转基因大豆的农民却大幅增加了除草剂的使用。研究人员认为这一现象是抵抗草甘膦的杂草扩散导致的。一开始,除草剂的使用是下降的,但随着杂草发展出草甘膦抵抗能力,除草剂的种类和用量都在增长。
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发表于2016年09月12日 15时57分 星期一
来自创造生命
上个月,遗传学家Philipp Messer在纽约冷泉港实验室的一个拥挤礼堂内谈论了基因工程的一种受争议应用:基因驱动。一种特定性状从上一代传递到下一代的概率通常是50%,基因驱动可以将这种概率提高到将近100%。比如说,我们想要消灭传播疟疾的蚊子,利用基因驱动可以使得蚊子的后代全部是雄性,从而导致它们的灭绝。这种技术代表着人类在历史上首次拥有改变野生种群基因的能力。它也引起了有关道德和实践方面的担忧。基因驱动代表着人类的干预,不可避免会与大自然发生冲突,因为我们要消灭的东西会努力想要活下去。大自然一般会找到方法绕过人类的干预,就像病原体演化出抗生素抵抗,昆虫和野草挫败杀虫剂。MIT的演化工程师Kevin Esvelt认为,从长期看,即使有基因驱动,演化最终还是会胜利。在演化的时间尺度下,人类所做的一起都是无关紧要的。当然,灭绝是另一回事。基因驱动是一种年轻的技术,还没有真正释放到野外。
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发表于2016年09月07日 13时21分 星期三
来自等待时间检验
匿名读者 写道 "《自然》的通讯记者大卫·希拉诺斯基(David Cyranoski)认为其新闻报道不应作为实验可重复的证据。在接受果壳科学人的采访中,韩春雨否认说过“《自然》已证实我的实验可重复” ,坚持认为实验存在争议,新闻报道的结果就是“有的人做得出来,有的人做不出来。”成都商报的记者王毅在微博表示他对他的稿子负责,并向澎湃新闻表示采访内容都有录音。"
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发表于2016年09月06日 17时51分 星期二
来自NgAgo
匿名读者 写道 "韩春雨接受了成都商报的采访声称《自然》是第三方,调查是公正、正式的,结果是公开的,《自然》的结果就是,这个实验是可以重复的,但有的能够做出来,有的做不出来。目前,至少已经有3名科学家重复了该实验,但3人在接受戴卫调查后,不希望被打扰,要求匿名。他认为,《自然》的调查访谈结果已经相当于是公开回应了。

腾讯话题删除了敦请原始数据的专题(3638期快照),方舟子认为《知识分子》的三位主编,饶毅、鲁白、邵峰应该动用自身影响力给事件一个结论。"
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发表于2016年08月29日 20时03分 星期一
来自准备变异
科学家通常认为,病毒的感染是以一个病毒感染一个细胞的方式进行的。但上周发表在《Cell Host & Microbe》期刊上的一篇论文令研究人员重新思考病毒感染动物的方式。研究人员从特立尼达拉岛发现的一种库蚊身上分离出一种病毒,这种病毒会分解成几部分,而成功的感染需要蚊子接触到其中多个部分。举例来说,病毒有5个基因,每个基因都是孤立的,蚊子至少需要接触到4个基因才能被成功感染,否则就会失败,第五个基因看起来是可选的。这种病毒目前发现不会感染人类。
长城
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发表于2016年08月23日 16时21分 星期二
来自Deus Ex
CRISPR-cas9等基因编辑工具的出现让修改人类基因成为可能。未来人类有可能通过修改基因去提升智商、体能和颜值。修改人类DNA在西方引发了伦理方面的争议,但在中国争议则比较少,中国更有可能引领基因强化。西方民众对于基因强化技术的反对情绪,其首要原因是安全隐患,修改人类基因组有极大的风险;尽管在治疗某些疾病时,这些风险可能被接受;但如果是为了改善智商和外貌这样的非医学性状特征而冒风险,就难以为人所容了。不平等问题同样令人忧虑。但在中国和印度等国,民众在此问题上的态度则较为正面。老式的优生优育计划在中国民众中得到了较为普遍的认同。在中国等国,基因编辑领域的监管制度也宽松。即使有相关方面的管制,也多半是以指导方针、而非法规条例的形式存在。得益于政府财政拨款,中国在2015年成为了世界上第一个使用CRISPR-cas9工具编辑人类胚胎基因的国家。在使用CRISPR-cas9对人体非生殖性组织细胞进行基因修改用来治疗癌症方面,中国也处于领先位置。中国之所以能研发出这些基因强化技术,主要得益于两大主要因素的支持:其一,学术研究为相关技术的开发提供支撑;其二,民意普遍支持相关技术的运用。西方国家在这两点上都远远落后于中国。此外一个更深层次、更政治化的因素也可能在发挥作用。西方民主国家容易受公众舆论的影响,这是民主机制的设计原则使然。而在中国,情况则刚好相反。
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发表于2016年08月22日 12时37分 星期一
来自创造生命
《自然》报道中文),合成生物学家报告了迄今意义最为深远的一项细菌基因组重写结果。这一进展包括重新利用了大肠杆菌3.8%的碱基对。 论文发表在《科学》期刊上。研究人员换下了大肠杆菌64个遗传密码子中的7个。他们如今能通过在55个片段(每一个片段的长度为5万个碱基对)中合成DNA从而减少遗传密码子的数量。研究人员还将这些碎片组装到一个有功能的大肠杆菌中。 这项研究是推动设计具有新属性的生物体的重要一步,例如抵抗病毒的传染性。这项工作同时也被视为“人类基因组项目——书写”的原型——科学家打算利用该项目人工合成一个人类基因组。
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发表于2016年08月18日 19时21分 星期四
来自受够了
雄鼠对于雌性气味趋之若鹜,雌鼠释放的信息素会吸引雄性的求偶和交配行为。华盛顿大学的研究人员发现了一种只存在于雄鼠的特定神经元,用于探测雌鼠尿液中的信息素。进一步研究发现,这种神经元具有可塑性,长期暴露在雌性气味下后会消失,从而改变雄鼠的求偶行为,变得不再对雌性感兴趣。研究报告发表在《神经元》期刊上。研究人员筛选了数以万计的犁鼻器神经元,雄性和雌性之间的大部分神经元是相同的,但有一类神经元主要存在于雄性,几乎不存在于雌性。研究人员随后实验让雄鼠暴露在雌鼠尿液下两个月时间,发现神经元消失了,雄鼠也失去了响应雌鼠信息素的能力。而雌鼠暴露在雄鼠尿液下则没有类似影响。
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发表于2016年08月17日 19时45分 星期三
来自跨界
1995年,Peter Friedl 还是McGill大学的研究生,他在实验室里注意到了令他彻夜难眠的现象:成群的癌细胞在模拟人体细胞之间空间的纤维网中协调移动。一个多世纪以来,科学家知道个别的癌细胞会转移,通过血液和淋巴系统转移到身体的另外一侧。但没有人像Friedl那样目睹密集的癌细胞像一个癌细胞那样移动。这一现象是如此新颖而奇特,以至于论文多次被拒绝发表。Friedl和同事的这篇论文最终发表在《Cancer Research》期刊上。20年后,生物学家日益确信,肿瘤细胞的成群移动传播了许多最致命的转移性入侵。Friedl直到2013年读了哈佛教授Jeffrey Fredberg的一篇论文后才理解他及同事观察到的是什么。 Fredberg提出,细胞可能会拥堵——细胞像一个单位那样紧紧结合在一起。Friedl随后发表论文应用拥堵的概念实验性测量癌细胞。生物学家现在认识到,这一纯物理概念可能有助于理解生命最致命现象的基础生物学